Tangu kuanza kwa janga hili, upimaji wa uchunguzi umekuwa na jukumu muhimu katika kudhibiti kuenea kwa SARS-CoV-2, virusi vinavyosababisha.COVID 19.Vipimo vya haraka vya antijenikutekelezwa nyumbani au katika mazingira ya kimatibabu hutoa matokeo ndani ya dakika 15 au chini ya hapo.Mapema mtu anapogunduliwa, haraka anaweza kutafuta matibabu na kujitenga na wengine.Lakini vibadala vipya vya virusi vinapoonekana, lahaja hizo huenda zisigunduliwe na majaribio haya.
Vipimo vingi vya haraka vya antijeni vimeundwa kugundua protini ya SARS-CoV-2 nucleocapsid au N-protini.Protini hii hupatikana kwa wingi katika chembechembe za virusi na watu walioambukizwa.Seti ya mtihani wa harakas kwa kawaida huwa na kingamwili mbili tofauti za uchunguzi ambazo hufunga kwenye sehemu tofauti za protini N.Kingamwili kinapojifunga kwa protini ya N katika sampuli, mstari wa rangi au ishara nyingine huonekana kwenye kifaa cha majaribio, kuashiria maambukizi.
Protini N ina vitengo 419 vya muundo wa asidi ya amino.Yoyote kati yao inaweza kubadilishwa na asidi nyingine ya amino kwa mabadiliko.Kikundi cha utafiti kinachoongozwa na Ph.D.Philip Frank na Eric Ortlund wa Chuo Kikuu cha Emory waliazimia kuchunguza jinsi badiliko hili moja la asidi ya amino linavyoathiri utendaji wa jaribio la haraka la antijeni.Walitumia mbinu inayoitwa uchunguzi wa kina wa mabadiliko ili kutathmini wakati huo huo jinsi kila mabadiliko katika protini ya N ya virusi huathiri kuunganishwa kwa kingamwili ya uchunguzi.Matokeo yao yalichapishwa katika Cell mnamo Septemba 15, 2022.
Watafiti waliunda maktaba ya kina ya karibu mabadiliko 8,000 ya protini ya N.Vibadala hivi vinachangia zaidi ya 99.5% ya mabadiliko yote yanayowezekana.Kisha wakatathmini jinsi kila lahaja ilivyoingiliana na kingamwili 17 tofauti za uchunguzi zilizotumika katika majaribio 11 ya antijeni ya haraka yanayopatikana kibiashara, ikijumuisha kawaida.seti za nyumbani.
Timu ilitathmini ni mabadiliko yapi ya N-protini yanayoathiri utambuzi wa kingamwili.Kulingana na maelezo haya, waliunda "wasifu wa mabadiliko ya kutoroka" kwa kila kingamwili ya uchunguzi.Wasifu huu unabainisha mabadiliko mahususi katika protini ya N ambayo yanaweza kuathiri uwezo wa kingamwili kujifunga kwa lengo lake.Uchanganuzi ulionyesha kuwa kingamwili zinazotumiwa katika majaribio ya haraka ya leo hutambua na kufunga anuwai zote za zamani na za sasa za SARS-CoV-2 za wasiwasi na wasiwasi.
Ingawa kingamwili kadhaa za uchunguzi hutambua eneo moja la protini ya N, watafiti waligundua kuwa kila kingamwili ina saini ya kipekee ya mabadiliko ya kutoroka.Virusi vya SARS-CoV-2 vinaendelea kubadilika na kutoa lahaja mpya, data hii inaweza kutumika kuripoti kingamwili za vifaa vya majaribio ambazo zinaweza kuhitaji kutathminiwa upya.
"Utambuaji sahihi na mzuri wa watu walioambukizwa unasalia kuwa mkakati muhimu wa kupunguza COVID-19, na utafiti wetu hutoa habari juu ya mabadiliko yajayo ya SARS-CoV-2 ambayo yanaweza kuingilia utambuzi," Ortlund alisema."Matokeo yaliyoainishwa hapa yanaturuhusu kuzoea virusi hivi haraka kwani anuwai mpya zinaendelea kuibuka, zikiwasilisha athari za kliniki na afya ya umma."
Mandharinyuma: Mutation Deep Scan hutambua mabadiliko ya kutoroka katika SARS-CoV-2 nucleocapsid kwa kutumia majaribio ya haraka ya antijeni yanayopatikana kwa sasa.Frank F., Kin MM, Rao A., Bassit L., Liu H, Bowers HB, Patel AB, Kato ML, Sullivan JA, Greenleaf M., Piantadosi A., Lam VA, Hudson VH, Ortlund EA seli.2022 Septemba 15;185(19):3603-3616.e13.Wizara ya Mambo ya Ndani: 10.1016/j.cell.2022.08.010.Agosti 29, 2022 PMID: 36084631.
Ufadhili: Taasisi ya Kitaifa ya Upigaji Picha na Uhandisi wa Biomedical NIH (NIBIB), Taasisi ya Kitaifa ya Kisukari, Magonjwa ya Usagaji chakula na Figo (NIDDK) na Taasisi ya Kitaifa ya Magonjwa ya Mzio na Magonjwa ya Kuambukiza (NIAID), Jumuiya ya Moyo ya Marekani.
Mambo ya Utafiti wa NIH ni sasisho la kila wiki la matokeo muhimu ya utafiti wa NIH yaliyopitiwa na wataalam wa NIH.Imechapishwa na Ofisi ya Mawasiliano na Masuala ya Umma ya Mkurugenzi wa Taasisi za Kitaifa za Afya.